Ostatnio,Tygodnik China CDCopublikował ważny artykuł badawczy opisujący badania epidemiologiczne i etiologiczne ogniska ostrego zapalenia żołądka i jelit wywołanego rotawirusem grupy C (RVC) w szkole podstawowej w Luzhou w prowincji Syczuan w październiku 2025 roku. Co istotne, wysokoprzepustowy zestaw do wychwytywania patogenów (wychwyt sondy) oraz technologia sekwencjonowania wzbogaconego całego genomu firmy Macro & Micro-Test odegrały kluczową rolę w tym badaniu. Umożliwiając dokładną identyfikację patogenów i kompleksową charakterystykę genomiczną, technologia ta dostarczyła kluczowych dowodów naukowych dla szybkiego potwierdzenia ogniska, precyzyjnego śledzenia źródła i skutecznej kontroli ognisk.
Nagły wybuch epidemii: Pierwszy zgłoszony wybuch RVC w południowo-zachodnich Chinach
15 października 2025 roku w szkole podstawowej w Luzhou doszło do ostrego zapalenia żołądka i jelit. W szkole uczyło się łącznie 1943 uczniów i pracowników. Zgłoszono 32 przypadki, w tym 6 potwierdzonych laboratoryjnie i 26 zdiagnozowanych klinicznie, co dało ogólny wskaźnik zachorowań na poziomie 1,65%. Szczyt zachorowań nastąpił między 15 a 16 października, a najwyższy wskaźnik zachorowań (23,08%) odnotowano w klasach siódmych i piątych. Większość pacjentów stanowiły dzieci w wieku szkolnym (mediana wieku: 10 lat), u których występowały głównie wymioty (65,62%), biegunka (46,87%) i ból brzucha (37,50%). Objawy utrzymywały się zazwyczaj od 1 do 3 dni, a wszyscy pacjenci wyzdrowieli bez poważnych powikłań.
Dochodzenie epidemiologiczne zidentyfikowało przypadek indeksowy jako 11-letniego chłopca z klasy 7. i 5. U jego młodszej siostry występowały podobne objawy, co sugeruje, że pierwotnym źródłem zakażenia była transmisja domowa. Niewłaściwe zarządzanie wymiocinami na terenie szkoły – w tym bezpośrednie zamiatanie i usuwanie ich bez terminowej dezynfekcji lub izolacji obszaru – w połączeniu z niedostateczną higieną rąk wśród uczniów, prawdopodobnie sprzyjało dalszej transmisji. Większość dotkniętych klas znajdowała się między drugim a piątym piętrem i miała wspólne męskie toalety, co wskazuje, że do rozprzestrzeniania się wirusa mogły przyczynić się zarówno transmisja drogą kropelkową, jak i kontaktowa.
Dochodzenie okazało się szczególnie trudne, ponieważ rutynowe badania przesiewowe na obecność patogenów, w tym testy na norowirusa i rotawirusa grupy A, dawały wyniki negatywne, co wskazywało, że odpowiedzialny był nietypowy patogen.
Diagnoza etiologiczna: sekwencjonowanie całego genomu metodą Macro & Micro-Test pozwala zidentyfikować winowajcę
Wstępny test na obecność norowirusa dał wynik negatywny. Następnie, Luzhou CDC zastosowało multipleksowy test PCR w czasie rzeczywistym na obecność patogenów żołądkowo-jelitowych, umożliwiający jednoczesne wykrycie 28 patogenów, w tym 8 wirusów, 17 bakterii i 3 pasożytów, do przebadania ośmiu próbek klinicznych. 17 października sześć próbek dało wynik pozytywny na obecność rotawirusa grupy C, co pozwoliło na identyfikację patogenu wywołującego chorobę.
Aby dokładniej wyśledzić źródło epidemii, badacze wykonali sekwencjonowanie metagenomiczne nanoporowe oraz sekwencjonowanie wzbogacające całego genomu metodą wychwytywania sond firmy Macro & Micro-Test na pięciu pozytywnych próbkach. To podejście pozwoliło na wygenerowanie pięciu kompletnych sekwencji genomu RVC (SC01–SC05). Zintegrowana strategia szybkiego multipleksowego PCR, a następnie sekwencjonowanie całego genomu o wysokiej rozdzielczości, zapewniła solidne wsparcie techniczne dla dokładnej epidemiologii molekularnej i śledzenia źródła.
Spostrzeżenia naukowe: Pierwsza identyfikacja genotypu M2 w południowo-zachodnich Chinach
Bazując na wysokiej jakości danych obejmujących cały genom, wygenerowanych przy użyciu technologii Macro & Micro-Test, zespół badawczy przedstawił kilka ważnych odkryć naukowych:
Potwierdzenie wybuchu epidemii monoklonalnej:Wszystkie pięć izolatów wirusa miało identyczny genotyp całego genomu (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), z zaledwie 0–1 różnicami w pojedynczym polimorfizmie nukleotydu (SNP), co ostatecznie dowodzi, że wybuch epidemii miał swoje źródło w pojedynczym łańcuchu transmisji.
Odkrycie genotypu M2:Analiza filogenetyczna wykazała, że szczepy Luzhou RVC należały do genotypu M2, a nie do genotypu M3, który wcześniej uważano za dominujący wśród chińskich szczepów RVC. Odkrycie to podważa konwencjonalną interpretację rozmieszczenia genotypów RVC w Chinach i potwierdza pojawienie się genotypu M2 w południowo-zachodnich Chinach.
Dowody na istnienie międzynarodowych powiązań transmisyjnych:Porównanie całego genomu wykazało duże podobieństwo genetyczne między szczepami Luzhou i szczepami RVC wcześniej raportowanymi w Junnanie (2025), Nowosybirsku (Rosja) (2017) i we Włoszech (2012), co sugeruje istnienie aktywnej euroazjatyckiej sieci transmisji wirusa.
Implikacje dla zapobiegania i kontroli: wczesne wykrywanie i szybka interwencja są niezbędne
Po zidentyfikowaniu patogenu, Luzhou CDC natychmiast wdrożyło kompleksowe środki kontroli, w tym izolację przypadków, dezynfekcję środowiska, ujednolicone postępowanie z wymiocinami oraz tymczasowe zawieszenie zajęć. Ognisko udało się skutecznie opanować w ciągu jednego okresu inkubacji, a po 21 października nie odnotowano żadnych nowych przypadków.
Badanie to dostarcza również ważnej lekcji dla zdrowia publicznego: w przypadku ognisk ogniska zapalenia żołądka i jelit, w których testy na rotawirusy grupy A i norowirusy dają wynik ujemny, badania na obecność rotawirusów grupy C i innych rotawirusów nienależących do grupy A należy włączyć do rutynowych badań diagnostycznych.
Niniejsze badanie stanowi pierwszy zgłoszony przypadek wybuchu epidemii rotawirusa grupy C w południowo-zachodnich Chinach i pierwszą identyfikację genotypu M2 w tym regionie, poszerzając obecną wiedzę na temat epidemiologii RVC w Azji Wschodniej. W tym badaniu zintegrowane rozwiązanie firmy Macro & Micro-Test, łączące multipleksowe badanie PCR z sekwencjonowaniem wzbogacającym cały genom, wykazało istotną wartość praktyczną, umożliwiając zarówno szybką identyfikację patogenów, jak i molekularne śledzenie źródła o wysokiej rozdzielczości, zapewniając powtarzalne ramy techniczne do precyzyjnego badania i kontroli przyszłych ognisk chorób zakaźnych.
Czas publikacji: 30 lipca 2026 r.