Ludzki metylowany gen NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2

U dorosłych codziennie ponad 108 komórek nabłonka jelitowego odpada ze ściany jelita i jest wydalanych z kałem w wyniku perystaltyki jelita grubego.Ze względu na to, że komórki nowotworowe są bardziej podatne na wypadanie z przewodu pokarmowego w wyniku nieprawidłowej proliferacji, kał pacjentów z nowotworem jelita zawiera wiele chorych komórek i nieprawidłowych składników komórkowych, co stanowi materialną podstawę do stabilnego wykrywania stolca.Badania wykazały, że modyfikacja metylacji promotorów genów jest wczesnym etapem powstawania nowotworów, a materiał genetyczny uzyskany z próbek kału pacjentów z rakiem jelita grubego może odzwierciedlać wcześniejszą obecność raka w jelicie.

NDRG4, znany również jako SMAP-8 i BDM1, jest jednym z czterech członków rodziny genów NDRG (NDRG1-4), który, jak wykazano, jest powiązany z proliferacją, różnicowaniem, rozwojem i stresem komórek.Potwierdzono, że metylacja NDRG4 jest potencjalnym biomarkerem do nieinwazyjnego wykrywania raka jelita grubego w próbkach kału.

SEPT9 należy do rodziny genów Septin, która składa się z co najmniej 13 genów kodujących konserwatywną domenę GTPazy, która może wiązać białka związane z cytoszkieletem i jest powiązana z podziałem komórkowym i powstawaniem nowotworów.Badania wykazały, że zawartość metylowanego genu Septin9 jest charakterystycznie zwiększona w próbkach kału od pacjentów chorych na raka jelita grubego.

Wydzielone białka związane z frizzled (sFRP) to rozpuszczalne białka, które stanowią klasę antagonistów szlaku Wnt ze względu na ich wysoką homologię strukturalną z receptorem frizzled (Fz) dla sygnalizacji Wnt.Inaktywacja genu SFRP powoduje niekontrolowaną aktywację sygnalizacji Wnt związaną z rakiem jelita grubego.Obecnie metylacja SFRP2 w kale może być stosowana jako nieinwazyjny biomarker w diagnostyce raka jelita grubego.

BMP3 należy do nadrodziny TGF-B i dlatego odgrywa ważną rolę w rozwoju embrionalnym poprzez indukcję i kształtowanie wczesnego tworzenia kości.BMP3 ulega hipermetylacji w przypadku raka jelita grubego i może być stosowany jako ważny marker nowotworowy.

SDC2 to proteoglikan siarczanu heparanu znajdujący się na powierzchni komórki, biorący udział w regulacji wielu procesów fizjologicznych i patologicznych.Przetwarzanie fizyczne obejmuje proliferację komórek, różnicowanie, adhezję, organizację cytoszkieletu, migrację, gojenie się ran, komunikację komórka-macierz, angiogenezę;Procesy patologiczne obejmują zapalenie i raka.Poziom metylacji genu SDC2 w tkankach raka jelita grubego był znacząco wyższy niż w tkankach prawidłowych.